2043年7月1日,黑帮头目犯罪大王将军(卢惠光饰)被捕,一星期后由公正严厉的法官余铁雄(张卫健饰)主审。为了阻止将军被判罪,他派出黑社会手下健(郑伊健饰)回到50年前的1993年,寻找铁雄并洗脑,使他无法进行审判。政府得知情况后派遣飞龙特警铁面(刘德华饰)、扫帚头(张学友饰)和发达星(任达华饰)回到1993年,保护铁雄。
这时,铁雄正在一所中学任教。在学校里,长期被同学余忌安(许志安饰)欺负的大雄(即铁雄的化名)只有女友采妮(杨采妮饰)对他真心。飞龙三特警混入学校,其中扫帚头成为老师,铁面成为大雄的同学,发达星则是大雄的跟班,帮助大雄打败忌安,并通过他获取铁雄的下落。但是,大雄表示学校里没有铁雄这个人。与此同时,健也冒充老师进入学校。另一边,大雄的母亲要改嫁给理查德余。最终,飞龙特警能否成功完成任务呢?