“希望篇”是“希望之峰学园系列”的完结篇。它讲述的是在“超高校级的绝望”带来的“人类史上最大最恶的绝望事件”之下,世界正处于崩溃的边缘。为了拯救这个充满绝望的世界,人们组成了“未来机关”。苗木等78期生打倒了江之岛盾子,加入了未来机关,并继续着复兴世界的行动。然而,苗木被指控为“绝望的残党”,引发了未来机关众人的团结。但黑白熊却将他们囚禁,并命令他们进行“最后的自相残杀”。他们的手臂被戴上神秘的手环,一旦时间结束就会被注射安眠药,而且还存在着“背叛者”暗藏其中。在这场极限死亡游戏中,苗木等人被迫面对生死选择。绝望的故事以希望杀死希望的方式展开。而“绝望篇”则讲述的是政府认可的培养出各个领域的超一流高中生的“希望之峰学园”,隐藏着的黑暗真相。最终,希望和绝望的殊死搏斗将迎来最终的结局。