在这部电影中,一件惊人的事件发生在全球。据报道,一个全身闪闪发光的巨大生物,被称为哥斯拉(Godzilla),在香港登陆。这个巨大的怪物开始破坏港岛和九龙的繁荣商业区,然后又消失在海洋中。这个事件引发了全球各地的关注,许多科学家和军事部门都开始研究这个神秘的生物。随着调查的深入,发现哥斯拉体内的冷却系统已经受到破坏,导致核子分裂加速,使哥斯拉的体温不断上升,达到惊人的一千二百度。这使得哥斯拉变得更加危险,可能会引发全人类的灭亡。与此同时,在东京的海底,一支名为东京海底队的特别小组也在进行着他们的调查。他们发现,隧道机械的主轴不断出现溶化,造成一系列事故。经过进一步的研究,他们发现这是哥斯拉体内的冷却系统导致的。在另一处,东京的水族馆发生了一系列神秘的事件。水族馆内的鱼类被发现离奇死亡,研究发现是来自二亿多年前的地层生物—狄斯亚(Dysil)所造成的。面对这些异常的事件,日本政府决定派出自卫队迎战这些巨大的生物。但是面对哥斯拉这样的超级怪物,自卫队的武器似乎没有任何作用。就在危急时刻,东京海底队与自卫队合作,成功冷冻了哥斯拉的身体。然而,就在人们以为一切都已经结束时,新的威胁出现了。生活在海洋深处的狄斯亚也被发现正在慢慢苏醒。面对这两个巨大的生物,人类将面临前所未有的挑战。他们能否找到有效的方式阻止这场灾难,拯救人类?一场世界性的战争将会展开……