1940年9月,德国、意大利和日本三国结成同盟。山本五十六被任命为日本联合舰队总司令,不得不接受对美国、英国和荷兰等国开战的命令,违背了自己的意愿。1941年12月8日零时,山本五十六下达了“1280”代码的命令,率领部队偷袭美国太平洋舰队,在珍珠港造成重大伤害并获得了胜利。随后,山本五十六提议与美国和谈,但意见未被采纳。在指挥中途岛战役时,由于战略上的重大失误,日本海军遭受惨重损失。形势急转直下,美军发动强大攻势,日军节节败退。瓜达康纳岛上有三万多名日本陆军,受到了美军日夜不停的轰炸,处于绝境。为了帮助尚存的陆军安全撤退,山本五十六派出舰队炮击美军基地。1943年4月18日,山本五十六乘坐轰炸机前往前线视察,以鼓舞士气。然而,日军的密码被美军窃取,美军派出空军机队将山本五十六的座机击落,一代军事领袖山本五十六就此在太平洋上空殒命。