《流星少女》讲述了宋忆橘和萧井两个大学生之间的故事。宋忆橘是中医学院的大四学生,一直靠助教萧井的帮助才能顺利获得学分。二人多年来都是互帮互助的关系。然而,在一次白昼流星后,萧井却开始出现反常行为,让水玩耍达人宋忆橘感到困惑,引起了她的警觉。原来,萧井其实是来自未来时空的人,他潜入现实时空的目的是为了接近宋忆橘的爷爷,并偷走他正在培育的一株珍贵草药。但是由于穿越时空造成了三个月的偏差,而宋爷爷又将宋忆橘交给萧井照顾,这一切都让萧井感到头疼不已。为了达到自己的目的,萧井只能勉强和宋忆橘交往,却在这个过程中被阳光直爽的宋忆橘治愈,逐渐找到了内心的平静。但是,正当两人感情发展的时候,离别却悄然而至。萧井必须回到自己的时空,让宋忆橘独自面对未来的挑战。在这段特殊的相处时光中,萧井和宋忆橘一起经历了许多有趣的冒险,也学到了许多珍贵的人生道理。虽然最终他们要分开,但是这段经历却让他们的心灵变得更加丰盈。最后,萧井带着对宋忆橘的美好回忆回到了自己的时空,而宋忆橘也开始勇敢地面对未来的挑战,完成了自己的成长之旅。