在真新镇,每个年满10岁的少年都有资格开始训练神奇宝贝。10岁的小智,立志成为最厉害的神奇宝贝训练大师,即将展开他的修行之旅。但由于赖床迟到,小智差点失去了挑选神奇宝贝的机会。最后,他只能选择被挑剩下的皮卡丘作为自己的神奇宝贝。皮卡丘又名电气鼠,虽然长得可爱,但性格害羞、不亲近人类,一有不满就会放电,让小智遭受不少苦头。大木博士把神奇宝贝图和宝贝球作为践行礼物送给了小智。在小智和皮卡丘面前,神奇宝贝的世界充满了谜题和冒险,他们将会面临光明和黑暗的挑战。最终,小智能否实现自己的梦想,成为神奇宝贝大师?