2100年,人类在建立了完善的社会系统后,开始向外宇宙进发。然而,没有人预料到微观世界中隐藏着一种名为RYNAX的物质。当人类的扩张欲望变得无限膨胀时,RYNAX开始向外界“溢出”,并将遇到的所有物质转化为原子。如果RYNAX继续蔓延到人类世界,后果将不堪设想。天箕博士是一位量子物理学家,他和研究团队在进行原子撞击试验时,发现两束光芒击中了来参观的天箕博士的女儿クラウ(12岁)。女孩的身体被当场分解,然后又在光芒中恢复成人形。博士赶紧停止试验并确认女儿的安危,但此时的クラウ已经自称为“RYNAX”。故事从事故发生后的10年开始,クラウ依靠寄宿在体内的神奇力量成为暗中维护社会治安的特殊谍报员之一。然而在22岁那天,クラウ体内出现了一个自称为“对”的女孩,还保持着クラウ12岁的外貌。一些组织对クラウ的特殊能力产生兴趣,想方设法绑架她。整个故事涉及了许多微观世界的理论,意图通过RYNAX向人类自身的向往外部世界的问题进行映射。