公元2010年,全球遭受巨大损失,人口减少到30亿,世界地图发生了巨大变化。在日本,政府设立经济特区重建国家,使用“力量辅助”技术取得成功。然而,其他地区仍陷入贫穷,贫民区不断扩大。统治阶级“Logos”使用这项技术来压制反抗者,“Levinas”则被排斥。时光流逝,公元2035年,主人公葛城丈和伙伴鹤泽是特殊部队“幻影”的成员,被派去监视“Levinas”。在一次任务中,他们遇到了神秘的少女登戸沙那。围绕着沙那,各种人的思想纷纭交织,故事随着他们的前进而展开。他们面临的未知究竟是什么......