少年剑心,一位生活在日本幕府末期的年轻剑客,在外患内乱的年代生活着。因为善良纯洁的内心,他被飞天御剑流高手比古清十郎收为徒弟,改名为剑心,学习剑法。
在国家危机的时候,剑心加入奇兵队,并被桂小五郎收为麾下,为改变时代而奋斗。年仅15岁的剑心接连暗杀多名政府要员,令对手闻风丧胆,直到一次意外,他的脸上留下了无法愈合的伤疤。
雪代巴来到京都寻找自己的爱人,却邂逅了剑心。但正是这个瘦弱的男子,将她的爱人从她的生命中带走。巴走进剑心的生活,经历了政治斗争的残酷和田园生活的宁静。虽然她给剑心带来了一丝平静,但在大时代的背景下,他们的幸福并不稳固,随时都可能被摧毁。