学园都市是东京西部的一个巨大都市,总人口达230万人,其中约有80%是学生。这座都市实施的是超能力开发的特殊课程,学生们的能力被分为从“无能力Level0”到“超能力Level5”的六个等级。
在这个学园都市中,统治着所有能力者的最强者,他就是超能力Level5中位居第一的一方通行。他拥有无与伦比的能力,在这个只有七名超能力者的都市里也是无人能敌的存在。但是,他的能力让他过着充满杀戮的日常,不断重复着被称为“实验”的任务,直到最终追求绝对力量的他也尝到了失败的滋味。
然而,一次偶然的相遇,他与一位少女的相遇改变了他的命运。最终,他成为了最强而最凶的“恶”,扫平了学园都市里的一切黑暗,成为了最终的胜利者!