Shadw印第安纳琼斯博士和他的伙伴们来到中国与上海黑帮老大交易,但对方却背信弃义,想要杀死他们。在危急关头,他们被一个机灵的小男孩豆丁和一位歌女威莉救下。他们乘坐的飞机失事,漂流到了印度的一个村子。村子里面民不聊生,因为河水干涸,庄稼尽毁,饥荒横行。当地人认为这一切都是彭高皇宫的妖孽作怪,把从天而降的三人当作神灵。他们请求琼斯帮助他们拿回被掳走的圣石和所有的小孩子。
随后,琼斯一行进入了彭高皇宫,发现这里充满了古怪。贵族们吃着水蛭、巨蟒、甲虫和猴脑,皇宫内部更是设有重重机关。他们意外目睹了血腥的邪教献祭仪式。这场战斗注定是艰苦的,但是琼斯决心要拯救村民,拿回圣石,解救所有的小孩子。