在战国时期，武田军队残忍地对待人民，年轻的忍者越智吉丹受够了这样的行为，决定追寻主权的梦想，开始四处流浪。不料，越智吉丹被武田最优秀的忍者雀的三郎左盯上了。与三郎左同时瞄准越智吉丹的还有铜子播磨，最终，越智吉丹在一个偶然的机会下结识了一个像山猿一样的乡下武士，被他劝说加入了马借队伍。马借队伍由有吉宗介为队长，小磯(本名为佐木里)为指挥，以运输大米和盐为职业。田舍武士其实是織田家的家臣木下藤吉郎，他来拜访马借队伍，委托他们运输最新武器“种子岛”。藤吉郎巧妙地说服有吉一伙接下这个任务。同时，他还劝说村上水军的参谋百藏和滝姬加入运输队伍。在种子岛运抵的那天，武田的忍者袭击了村上水军的船只，但是打开包裹却发现里面装的是石块。与此同时，有吉一伙也运送着“种子岛”，在路上遭遇了许多挑战。最终，他们成功将武器运送到了目的地。