这是一个围绕着小提琴、父子关系的故事。故事的敌人是以生命能量为食的吸血鬼族Fungaia。主人公红渡是继承父亲工坊的小提琴制作师，通过腰带变身为假面骑士牙，与Fungaia战斗。但他对自己为何能变身、为何要战斗还不清楚。实际上，22年前，父亲音也就开始与Fungaia战斗。故事将现在和22年前紧密联系起来。22年前，音也未能消灭的Fungaia如今在现代日本不断繁衍。渡变身为假面骑士牙，打倒Fungaia，将过去和现在连接起来。但存在的不仅仅是肉眼所能看到的形态。生活在不同时代的人们的命运将如何连接？Fungaia的出现为何会威胁到人类？到底谁才是真正的敌人？