2131年，地球陷入了一场前所未有的大规模世界大战，各大主要城市全都变成了废墟，数以千计的人们流离失所。然而令人讽刺的是，这场毁灭人类文明的战争最终没有任何胜利者。倖存下来的人类将原本的综合管理组织改造成了一个名为奥林帕斯的基地，希望能够成为倖存者的理想国。
在一座废弃的城市里，少女琉南•纳兹和一群火力强大的人造人展开了一场激烈的战斗。就在危急时刻，她的前男友布里亚留斯和一位美丽的女孩瞳赶来营救。布里亚留斯以前曾在北非战场上丧失了大部分的身体，如今也被改造成了身具机械零件的人造人。结束了长久的苦战，琉南终于可以迎来平静宁静的生活。然而，她很快就发现奥林帕斯的科技非常发达，而且这里也有大量的人造人。这个过分平静的理想国让琉南感到一丝不安，似乎有着许多不为人知的秘密隐藏在背后。