在一个未来世界，军方研发了一种药物来增强战士的作战能力，但不幸导致大量民众沾染失败的实验药物，从而孕育出身体异于常人的生化人群体。为了控制这些生化人，军方建造了庞大的隔离建筑，并制造出可对抗生化人的最终武器。生化人组织派出女战士紫罗兰（由米拉·乔沃维奇饰演）潜入军方内部，企图以暴力手段夺取最终武器。然而，在任务过程中，紫罗兰无意中发现最终武器内部竟是一名男童（由卡梅伦·布莱特饰演）。原来，男童拥有可以消灭生化人的血液抗原，而且据说还能使生化人恢复成人类形态。紫罗兰觉得这个抗原可以为生化人带来重大改变，决定背叛生化人组织，带着男童（被称为“6号”）一起逃离并躲避军方和生化人组织的追击。然而，男童背后还隐藏着更大的秘密等待揭开。