《遗失的时光》讲述了14岁的李秀妍因被贴上“杀人犯女儿”的标签后受到孤立，在学校里总是低着头行走。直到遇到愿意和自己做朋友的韩正宇，一切都发生了改变。在一个雨天，正宇被绑架，秀妍也被带走。在绑架犯短暂离开的时候，正宇挣脱绳索看了一眼秀妍，然后逃跑了。从此，两人再也没有见过面。 14年后，成为重案组刑警的正宇为了抚平心中的伤痛，全身心投入到追捕犯人的工作中。秀妍则成为有着不为人知痛苦经历的时尚设计师Zoe。姜亨俊为了逃避即将杀害他的父亲韩泰准，不得不与母亲分离。在这段艰难的时期，他偶然遇到了秀妍，从此开始了一段美好的感情。金恩珠为了找到害死父亲的凶手，一直努力想成为警察，但三次考试都失败了。她除了对父亲的思念，还暗恋着正宇。四人的命运在此后的故事中交织在一起。他们为了找出真相、面对过去的伤痛而共同努力，最终获得了幸福。