1949年，解放军和平解放了新疆，随后成立了新疆军区，其中甘祖昌担任后勤部副部长。当时，敌特支持的投机倒把分子在新疆制造了物价混乱，大肆垄断黄金和银圆，企图通过经济手段来困扰解放军，甘祖昌为了打击这些奸商的气焰，低价将银圆投入市场流通，稳定了市场和政局的局面。然而，为了报复甘祖昌，敌特分子制造了一次车祸，导致他受重伤。1955年，甘祖昌被授予少将军衔，而与他一同入伍的李保山则被授予校衔。李对甘的升迁心怀嫉妒，最终因违纪而被解职回乡。由于脑震荡后遗症的严重影响，甘祖昌自知不再适合继续服务军队，再加上回到家乡后看到虽然已经解放但生活仍然贫困，于是他主动请求辞职，解除军装，回到江西莲花县的老家沿背村。回到乡下后，甘祖昌不辞辛劳，继续为家乡的经济建设贡献自己的力量。他克服了种种困难，修建水库，整修水旱田，建立公社农科所等，为农民的生活带来了巨大改善。甘祖昌不留恋高位，而是选择奉献。他不追求享受，而是甘愿奋斗。他的精神成为领导干部的榜样，也成为当时时代的先锋。