《迷宫谜案》是一部悬疑惊悚电影，故事发生在日本冈山县和兵库县之间边界的小村庄鬼首村。这里有两大家族，良家和仁礼家，相互对立。一天，冈山县警察局警部矶川常次郎邀请金田一耕助来到一家名为龟之汤的温泉旅馆。旅馆女主人青池里佳失去了丈夫源次郎，而凶手恩田幾三至今仍然下落不明。 20年后，出身于鬼首村的人气歌手大空由加里回到家乡，引起全村的欢欢喜喜。就在这时，青池里佳的儿子歌名雄的未婚妻由良泰子被发现死在瀑布下。凶手似乎是用一种古老的中国绳法杀害的。冈山县警察局开始对这件案件展开调查，但是受制于两大家族的影响，调查并不顺利。为了解决这起离奇的谋杀案件，金田一耕助和矶川警部展开了潜在的险恶战争。随着调查的深入，一层层的谜团被揭开，让人们惊讶的是，歌名雄和大空由加里也卷入了这场阴谋之中。最后，谋杀案的真相大白于天下。这起案件牵扯的真相和未来，将会引起村民们的争议。