在远古时代,两个截然不同的种族——汽车人和霸天虎,展开了一场持续数个世纪的战争。他们的后代巨无霸和原始兽,则在新的时代继承了这场无休止的争斗。为了寻找新的能源,霸天虎指挥原始兽通过时空跳跃来到史前地球,而巨无霸也在擎天圣的带领下紧随其后。双方的战斗依然不断,甚至连早已占据这个星球的外星人沃克人也被卷入其中。但就在此时,穿越时空者传递的未来信息让沃克人大为震惊,由此使得战斗更加激烈。为了改变霸天虎的战败命运,霸王龙发现了留在地球的战舰方舟号,试图摧毁沉睡中的擎天柱。
这场攸关整个宇宙命运的战斗,在远古时代就已经提前展开了序幕。