在一个电闪雷鸣的日子里，身陷囹圄的一只耳成功越狱，引起黑猫警长的高度重视。次日一早，受黑猫警长崇拜的小猪三嘟被伙伴大壮拉走，偷偷进入即将开幕的翡翠之星博物馆。博物馆的前身是一座宇宙飞船，六十年前由羊山博士亲手开发。就在他们玩得不亦乐乎时，突然发现了一只耳和一个邪恶之人，他们看起来鬼鬼祟祟。邪恶之人声称曾遭羊山博士背叛，听说羊山博士已去世后，愤怒无处发泄。狡猾的一只耳教唆邪恶之人将复仇的目标转移到全城人民，计划在后天博物馆开幕时绑架所有市民。
三嘟趁机夺走了一只耳手中的能量块，黑猫警长面临前所未有的巨大挑战。